Dependendo do grupo o qual o animal pertence, esse orifício pode executar primeiramente a função de boca – como é o caso dos protostômios- ou agir inicialmente como anus do organismo – no caso dos deuterostômios.
Ainda durante o processo da formação embrionária, os animais protostômios desenvolvem uma abertura que passa a ter a função de ânus, esta localizada na altura do extremo oposto do arquêntero.
Contrário ao processo que ocorre nos seres mais evoluídos, estes classificados como deuterostômios, o blastóporo, inicialmente com a função da boca, no grupo protostômios pode ser constatado em organismos como vermes, moluscos e artrópodes.
Posterior a essas etapas, o desenvolvimento embrionário dos animais protostômios passa para a fase da organogênese, que é caracterizada pelo processo de distinção de órgãos partindo dos folhetos embrionários gerados na gastrulação e cuja etapa inicial é chamada de neurulação.
Depois de concluída a fase da neurulação, os folhetos embrionários permanecem em um processo de diferenciação, dando origem aos tecidos especializados do adulto.